据专家介绍，膜结构工程的付款阶段分为开工预付款、中期进度款、竣工尾款和质量保证金四个阶段。膜结构价格结合整体环境，建造出标志性的形象工程，并且实用性强、应用领域广泛。既可应用了大型公共设施，如体育场馆的屋顶系统、机场大厅、展览中心、购物中心、停车场、站台设施等。又可应用于休闲设施、工业设施、入口廊道以及标志性或景观性的建筑、小品等。
由于膜结构工程量相对而言于公共建筑工程量小，加之一般用户在膜结构安装开始之前资金就已经准备就序，所以在和膜结构公司签订了正式的合同以后，预付给膜结构公司大约工程款的30%作为工程起动资金是较为合理的，这样才可以保证膜结构材料的用时到位，不影响工期的按时推进。
随着膜结构工程进度推移，用户应该如何反握中期进度款的支付数量呢？相关负责人指出，最先的预付款一般都是膜结构基层材料款和少量人工生活费，比如一开工就要使用的膜结构材料钢筋(英文:steel bar)预埋件等都由预付款支付。用户观察到自己的膜结构基层工程量已经基本完成并验收后，就可以考虑（consider)支付中期进度款了。膜结构中期进度款一般应支付工程款的士30%-50%为宜，因为膜结构主材料往往较基层材料贵一些，如果这个时候出现资金问题，最易出现耽误工期的情况。
膜结构中期进度款付完以后，应待到工程基本完成再支付10%的工程款作为工人工资，起到稳定（解释:稳固安定；没有变动)“军心”、把膜结构工程尾收好的作用。
膜结构工程竣工并将现场清理干净后，用户须保留工程总额的5%作为质量保证金，在规定时间内支付，其余膜结构工程尾款在竣工验收完毕，甲、乙双方都感到满意后一次性支付给膜结构公司。
有些用户在膜结构工程竣工后故意拖欠工程尾款，以为这样可以令膜结构公司不断为其改动、返修。业内人士表示，其实这种做法是不明智的，长此下去会令膜结构公司产生反感，不但不能促进返修进度，反而会使今后的膜结构售后服务无法保障。所以用户对竣工验收中存在的明显问题要令膜结构公司在短期内整改，并表明支付尾款的合理条件，报着协商解决的态度与膜结构公司达面共识。
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